Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms