Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms