Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msgn1Q9JK54 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms