Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx20Q9JJY4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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