Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra4Q9JJT2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms