Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Bco1Q9JJS6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Bco1Q9JJS6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Bco1Q9JJS6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Bco1Q9JJS6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Bco1Q9JJS6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Bco1Q9JJS6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Bco1Q9JJS6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Bco1Q9JJS6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Bco1Q9JJS6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Bco1Q9JJS6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Bco1Q9JJS6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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Bco1Q9JJS6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Bco1Q9JJS6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bco1Q9JJS6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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