Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1Q9JIT0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms