Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms