Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms