Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHR9

Nrip2, Nuclear receptor-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip2Q9JHR9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrip2Q9JHR9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrip2Q9JHR9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms