Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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