Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Tmod3Q9JHJ0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Tmod3Q9JHJ0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Tmod3Q9JHJ0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
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Tmod3Q9JHJ0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Tmod3Q9JHJ0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Tmod3Q9JHJ0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Tmod3Q9JHJ0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Tmod3Q9JHJ0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Tmod3Q9JHJ0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Tmod3Q9JHJ0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod3Q9JHJ0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Tmod3Q9JHJ0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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