Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms