Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Cldn19Q9ET38 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn19Q9ET38 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms