Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms