Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrnb2Q9ERK7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms