Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms