Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RhojQ9ER71 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms