Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx12Q9ER00 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms