Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgshQ9EQ08 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms