Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms