Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD06

Rarres2, Retinoic acid receptor responder protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres2Q9DD06 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rarres2Q9DD06 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rarres2Q9DD06 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms