Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3fQ9DCH4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms