Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC3

Ccdc107, Coiled-coil domain-containing protein 107, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc107Q9DCC3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc107Q9DCC3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms