Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne8Q9DC53 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne8Q9DC53 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms