Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms