Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms