Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg9Q9DB90 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms