Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fundc1Q9DB70 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fundc1Q9DB70 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Fundc1Q9DB70 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fundc1Q9DB70 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fundc1Q9DB70 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fundc1Q9DB70 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fundc1Q9DB70 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fundc1Q9DB70 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fundc1Q9DB70 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fundc1Q9DB70 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fundc1Q9DB70 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fundc1Q9DB70 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fundc1Q9DB70 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fundc1Q9DB70 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fundc1Q9DB70 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fundc1Q9DB70 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fundc1Q9DB70 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms