Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD6

Pfn3, Profilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn3Q9DAD6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfn3Q9DAD6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfn3Q9DAD6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfn3Q9DAD6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfn3Q9DAD6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfn3Q9DAD6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfn3Q9DAD6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms