Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DA42 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DA42 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DA42 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DA42 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DA42 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DA42 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DA42 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DA42 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DA42 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DA42 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DA42 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DA42 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DA42 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DA42 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DA42 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DA42 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DA42 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DA42 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DA42 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DA42 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DA42 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DA42 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DA42 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DA42 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DA42 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DA42 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DA42 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DA42 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DA42 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms