Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smco2Q9DA21 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smco2Q9DA21 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Smco2Q9DA21 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Smco2Q9DA21 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms