Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pdzd9Q9D9M4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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