Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms