Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e2Q9D902 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e2Q9D902 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e2Q9D902 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e2Q9D902 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e2Q9D902 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e2Q9D902 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e2Q9D902 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e2Q9D902 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e2Q9D902 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e2Q9D902 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e2Q9D902 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e2Q9D902 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e2Q9D902 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e2Q9D902 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e2Q9D902 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gtf2e2Q9D902 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gtf2e2Q9D902 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e2Q9D902 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms