Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U2

Tmem41a, Transmembrane protein 41A, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem41aQ9D8U2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem41aQ9D8U2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms