Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms