Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms