Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
U2af1Q9D883 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms