Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp5Q9D7S9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp5Q9D7S9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms