Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms