Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Klhl40Q9D783 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl40Q9D783 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms