Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc3Q9D6Y1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms