Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc94Q9D6J3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms