Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11fip1Q9D620 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms