Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc81Q9D5W4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms