Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4f1Q9D5Q6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms