Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ShpkQ9D5J6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ShpkQ9D5J6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ShpkQ9D5J6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ShpkQ9D5J6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ShpkQ9D5J6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ShpkQ9D5J6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ShpkQ9D5J6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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