Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc7Q9D541 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc7Q9D541 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms