Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms